根据全省第一次档案工作会议精神和万县地委“关于统一管理党、政档案工作的指示”，经县委研究决定，于1959年3月24日成立“奉节县档案馆”，统一管理党、政档案、资料。档案馆采用“四合一”的形式，即：它即是党、政合一的档案馆，又是县委、县人委的档案资料室，又是全县档案、资料工作业务指导机构，也是档案、资料干部的教育机构。其主要任务是“一、作为全县档案、资料的集中点（现暂不接收区、乡档案）；二、作为全县档案、资料的情报中心，积极开展档案、资料的利用工作，为党的中心工作和历史科学研究服务；三、负责全县档案、资料工作的业务指导；四、有计划地培训全县档案、资料干部。”三月三十一日，奉节县档案馆正式开始办公，配备干部3人，其中专职副馆长１人。办公地点设在奉节县人委办公室一楼，有库房4间，资料、阅览室、办公室各一间，文柜20口。1962年精减机构时，县委拟定撤销县档案馆，县档案馆副馆长严君白多次向县委、县人委领导反映情况，请求不予撤销县档案馆，1963年6月全省档案工作会议后才正式决定不撤销县档案馆。

    1967年1月，全国性的“无产阶级文化大革命”全面开展，县档案馆机构瘫痪，业务中断。1968年5月，奉节县革命委员会成立“奉节县革命委员会清查敌伪档案办公室”，接管了县档案馆的全部档案。1974年12月，撤销“奉节县革命委员会清查敌伪档案办公室”，恢复“奉节县档案馆”。

    1980年2月，中共奉节县委根据全国、全省档案工作会议精神和中共四川省委（1979）105号文件的规定，成立奉节县档案管理局，同奉节县档案馆合署办公，采取两块牌子、一套人马，以馆的名义接收、保管档案，以局的名义进行业务指导。2001年9月县机构改革时，保留了县档案局、县档案馆、县档案局由政府组成部门改为政府直属事业单位，参照公务员管理，仍与档案馆合署办公，实行一套班子，两块牌子的管理体制，断续行使八项职能。